GitHub немного тупенький и не умеет нормально показывать, что изменилось в PR после ребейза и форс-пуша. Чтобы облегчить себе и ревьюеру жизнь, стоит делать два форс-пуша: один для ребейза на главную ветку, а второй для обновления коммитов в вашей ветке. При таком подходе в истории PR будут две записи про форс-пуш, у каждой будет кнопочка “Compare”, и, соответственно, можно будет посмотреть отдельно изменения по мухам (изменениями, связанными с главной веткой) и отдельно по котлетам (изменениями коммитов в ветке).