Без понятия, почему это не включено по умолчанию, но хотя бы можно включить. В /etc/pulse/default.pa надо добавить

.ifexists module-echo-cancel.so
load-module module-echo-cancel aec_method=webrtc source_name=echocancel sink_name=echocancel1
set-default-source echocancel
set-default-sink echocancel1
.endif

И перезапустить PulseAudio (pulseaudio -k) или перезагрузиться. После этого в настройках звука появятся дополнительные входы/выходы с пометкой echo cancelled.