Python весьма неплох для стряпанья скриптиков. Однако если однотипных скриптиков становится много и появляется общий код, то тем или иным образом возникнет проблема с организацией папочек так, чтобы импорты работали нормально. Классический пример — импорт из “соседней” папки.

Проблема связана в основном с тем, что питон может быть запущен в непонятно каком окружении, в котором может даже не быть иерархической структуры модулей. Поэтому импортировать можно только из sys.path, в котором не всегда будет путь к нужному модулю. Основные способы решения проблемы сводятся к следующим вариантам:

  1. Вы все делаете неправильно, так писать код нельзя, срочно поменяйте свою структуру папок. Гвидо проклинает таких, как вы.
  2. Вы должны правильно настроить virtualenv, сделать одну из ваших папок пакетом и установить ее (как и любой пользователь ваших скриптов).
  3. Вы можете запускать свои скрипты как модули с флагом -m. Успехов вам в добавлении этого в мутные инструкции по запуску и в слежении за тем, чтобы при автоимпорте всех скриптов из папки ничего не сломалось.
  4. Вы можете грязным хаком добавить нужный путь в sys.path, например, так: 
    sys.path.append(str(pathlib.Path(__file__).resolve().parent.parent))
    Это самый простой и прямолинейный способ, но за него вы, разумеется, будете гореть в питоновском аду.

Подробнее про импорты можно прочитать тут и тут.

Я знаю, что среди немногочисленных читателей канала есть сеньор-питонисты — напишите пожалуйста в ЛС, как решаются подобные проблемы у вас.